As Linhas de Pesquisa representam temas aglutinadores de estudos científicos que se fundamentam, no caso do PGEDH,  na memória investigativa do Curso que se encontra na 3ª Edição. Outrossim, é destas Linhas de Pesquisa que se originaram e seguirão gerando-se projetos de pesquisa cujos resultados guardam afinidades entre si. Projetos de Pesquisa são, portanto, investigações com início e final definidos, fundamentados em objetivos específicos, visando a obtenção de resultados, de causa e efeito ou colocação de fatos novos em evidência.

As Linhas de Pesquisa do PGEDH e suas respectivas disciplinas  são:

• FUNDAMENTOS EM DIREITOS HUMANOS - Estudo  teórico-prático  dos  princípios  históricos,  ético-filosóficos, jurídicos e políticos fundamentando a educação em direitos humanos. 
  
  • Fundamentos Históricos da Educação em Direitos Humanos;
  • Fundamentos Ético-Filosóficos da Educação em Direitos Humanos;
  • Fundamentos Jurídicos da Educação em Direitos Humanos;
  • Fundamentos Políticos da Educação em Direitos Humanos. 

• DIREITOS HUMANOS, DIVERSIDADE E IDENTIDADES PLURAIS - Estudo  teórico-prático  sobre  a  diversidade,  o  gênero  e  as  relações étnico-raciais e a presença destes nos direitos humanos. 
  • Diversidade nos Direitos Humanos;
  • Diversidade e Gênero;
  • Diversidade e Relações Étnico-raciais. 

• DIREITOS HUMANOS NO CONTEXTO ESCOLAR E SEU ENTORNO - Estudo teórico-prático sobre educação, a escola e a sociedade tendo em  vista  a  formação  de  uma  cultura  fundada  nos  princípios  e  valores  que constituem os direitos humanos. 
  • Fundamentos Educacionais da Educação em Direitos Humanos;
  • Plano de Ação em Educação em Direitos Humanos;
  • Direitos Humanos: Ambiente Escolar e Práxis Pedagógica.